内蒙古大学创建于1957年，是新中国成立后在少数民族地区最早创立的一所综合性大学，在国家高等教育布局中具有重要作用和特殊区域定位。学校于1962年招收研究生，1984年获博士学位授予权。研究生管理机构源于1978年成立的内蒙古大学研究生办公室，1988年成立研究生处，2001年3月成立研究生院(筹)，2010年正式成立研究生院，2022年12月研究生院与研究生工作部合署办公。

经过60多年的发展，内蒙古大学熔炼出一支品德高尚、治学严谨、水平较高的研究生导师队伍，现有博士生导师400余人，硕士生导师1100余人，其中国家级人才48人。近些年，研究生培养能力显著提升，培养质量不断提高，研究生已经成为学校科研的生力军，目前在校博士和硕士研究生10000余人。

现有13个一级学科博士学位授权点，1个博士专业学位授权点，26个一级学科硕士学位授权点，1个二级学科硕士学位授权点，15个硕士专业学位授权点，9个博士后科研流动站，涵盖哲学、经济学、法学、文学、历史学、理学、工学、农学、管理学、艺术学等10个学科门类。生物学入选国家“双一流”建设学科和自治区“一流拔尖学科”，生态学、民族学、化学、计算机科学与技术、中国语言文学、数学、物理学、马克思主义理论入选自治区“一流拔尖培育学科”，应用经济学入选自治区“一流建设学科”。化学、工程学、环境/生态学、材料科学、植物与动物科学5个学科进入全球ESI排名前1%。拥有中国少数民族语言文学、动物学2个国家重点学科，生态学1个国家重点培育学科。

现有省部共建国家重点实验室1个，国家四部委铸牢中华民族共同体意识研究基地1个，国家地方联合工程研究中心1个，国家生态质量综合监测站3个，教育部国家语言文字推广基地1个，国家民委“一带一路”国别与区域研究中心1个，中国民族语言术语应用研究基地1个，教育部重点实验室、教育部工程研究中心等部级重点研究平台11个，内蒙古自治区重点实验室、工程技术研究中心、集成攻关大平台、人文社会科学重点研究基地等61个。